Младший научный сотрудник научной лаборатории молекулярной онкологии

Должностные обязанности:

• Разработка и оптимизация пайплайнов snakemake по обработке NGS данных (полученных на приборах Illumina и MGI);

• МВыполнение анализов ДНК секвенирования: таргетные панели и WES/WGS для поиска наследственных и соматических мутаций, CNV;

• Анализ РНК (bulk), включая поиск транслокаций и анализ дифференциальной экспрессии генов

Требования:

- Наличие опыта в анализе NGS данных (>1 года)

- Уверенное владение Python, bash

- Знание одного из инструментов сборки пайплайнов: Snakemake, NextFlow, CWL.

- Опыт работы с серверами на базе Linux

- Практический опыт работы с биоинформатическими библиотеками, такими как BWA, GATK, STAR, snpEff

Преимуществом будет:

Владение R

Опыт работы с Docker, conda, git

Понимание статистики и молекулярной биологии

Условия:

Оформление в соответствии с ТК РФ.
• Порядок рассмотрения резюме кандидатов: электронное резюме на электронную почту
• Мы предлагаем профессиональное и карьерное развитие, работу в команде профессионалов, в крупнейшем и известнейшем институте, в котором созданы все условия для работы.
• НМИЦ онкологии - социально ответственный работодатель.
• Место работы: пос. Песочный (удобное транспортное сообщение для жителей Выборгского, Калининского районов, частично Курортного, Приморского районов СПб, поселков Сертолово, Чёрная Речка Всеволожского района).
• Развозка от м. Озерки (Выборгское шоссе).