Биоинформатик/научный сотрудник

от 100 000 до 140 000 ₽ на руки

Вакансия находится в архиве

Требуемый опыт работы

От 1 года до 3 лет

Тип занятости

Полная занятость

График работы

Полный день

Центр постгеномных технологий приглашает научного сотрудника-биоинформатика, с уверенным владением Python, опытом в написании научных статей и желанием их писать, а также опытом самостоятельной работы.

Обязанности:

  • Основные задачи - в области геномики патогенных микроорганизмов, научная работа.
  • Разработка биоинформатических пайплайнов для автоматизации задач по обработке данных секвенирования.
  • Сборка и обработка референсных баз данных геномных последовательностей.
  • Подбор и тестирование праймерных последовательностей.
  • Представление результатов в виде научных статей, написание научных статей.
  • Составление отчётной документации.
  • Участие в разработке универсальных скрининговых систем.

Требования:

  • высшее образование профильное либо в смежной области (биология, молекулярная биология, биотехнология, биоинформатика, генетика и т.п.).
  • Опыт написания научных статей - обязательно и желание их писать.
  • Опыт обработки данных высокопроизводительного секвенирования.
  • Опыт работы с вычислительными кластерами (unix, bash, slurm).
  • Плюсом будет опыт работы в молекулярно-генетической лаборатории
  • Уверенное владение python:
    • Владение biopython
    • Владение библиотеками для статистической обработки и визуализации данных (pandas, numpy, matplotlib).
    • Знание синтаксиса SQL.
  • Умение работать с вычислительными кластерами (unix, bash, slurm)
  • Опыт работы с программными пакетами для:
    • картирования прочтений и аннотации вариантов нуклеотидной последовательности (bwa, Samtools, bcftools, GATK);
    • алгоритмов поиска и таксономической классификации.
  • Навыки быстрого анализа литературных данных.
  • Преимуществом будет владение программными пакетами для:
    • сборки геномов de novo
    • сборки геномов по референсу
    • алгоритмов поиска и таксономической классификации
    • построения попарных и множественных выравниваний последовательностей
    • проведения филогенетического анализа.

Условия:

  • оформление по ТК РФ.
  • Своевременная выплата заработной платы.
  • В начале работы (2-3 месяца) - присутствие в лаборатории каждый день по пятидневной рабочей неделе (время прихода и ухода с работы - по договоренности с непосредственным руководителем) с целью полного погружения в тему и работу лаборатории, далее можно рассмотреть режим работы - 2-3 дня присутственные дни, остальное время - дистанционно (по договоренности с непосредственным руководителем).
  • Возможность прикрепления к ведомственной поликлинике.
  • Возможность участвовать в научных конференциях, семинарах и обучающих программах.
  • Размер заработной платы обсуждается индивидуально, зависит от знаний, опыта, навыков.
  • Возможность профессионального роста.
  • Современная лаборатория с хорошим оборудованием.
  • Научные исследования имеют научно-прикладной характер.

Ключевые навыки

Python
De novo
Сборка геномов
Филогенетический анализ
Выравнивание последоватеьностей
Статистическая обработка
Базы данных
Анализ данных
Bash
Django rest pandas
Python (pandas, numpy, matplotlib)
Статистический анализ
Пайпланы
Научные статьи
Написание научных статей

Контактная информация

ФГБУ ЦСП ФМБА России

Сайт: cspmz.ru

Почта: не указана

Вакансия опубликована 26.10.2024 в г. Москва.

Похожие вакансии

#

Москва

Полный день

Подробное описание

7 июня

#

Москва

Беляево

и еще 2 станции

Подробное описание

26 июля

#

Москва

Полный день

Подробное описание

29 апреля